亚星游戏

科技处4月9日(星期三)讲座通知

  学术汇报 

  汇报标题:利用高频reads分析线状基因组的结尾 

            Characterization of termini of linear genome with high frequency reads 

  汇报人: 童贻刚 钻研员 

           军事医学科学院微生物盛行病钻研所 

  主持人: 陈 非 

  

  时  间:201449日(星期三)上午10:00-11:30 

  地  点:亚星游戏1层汇报厅 

  汇报提要 大部门病毒(尤其是噬菌体)都拥有线状基因组,相识这些基因组的结尾序列特点对于说明这些病毒的复造机造、包装机造以及病毒的性命周期拥有重要意思 。由于这些病毒基因组往往拥有结尾冗余(正向反复),导致在序列拼接时总是形成一个环状的基因组序列,无法判断基因组的肇始和终止位点的真正地位,因而必须用复杂的试验来确定基因组的肇始和终止地位 。本钻研利用高通量测序数据,在实现病毒基因组全序列拼接的同时,通过度析测序数据中的高频reads,直接确定基因组的高低游结尾序列,获得了数十株病毒的结尾序列 。同时为了证明此步骤的靠得住性,我们在病毒基因组结尾人为衔接接头,而后进行序列测定,所获得的了局与我们预期的了局齐全一致 。结论:本钻研利用高通量测序数据,在拼接全基因组的同时直接确定病毒基因组的结尾序列,为病毒基因组分析提供了额表的信息 。 

    

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