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国度基因组科学数据中心颁布猴痘病毒资源库

  6月10日,国度基因组科学数据中心正式颁布猴痘病毒资源库(Monkeypox Virus Resource, MPoxVR)。该库整合了美国国度生物技术信息中心(NCBI)公开颁布的全球414条猴痘病毒基因组序列数据和元信息,并对分歧猴痘病毒株的基因组序列做了变异分析与展示,同时提供基因组注解、基因组变异分析和注解、BLAST等在线分析工具,以及有关的SRA测序原始数据、学术文件、科普文章和其他猴痘资源数据库。

  MPoxVR将持续更新猴痘病毒和其他痘病毒科的元信息与基因组序列数据。当前收录和审编了起源于NCBI的GenBank数据库猴痘病毒株的株名、采样日期、采样地址、宿主、序列长度和序列齐全性等元信息。通过该资源库还可接见国度基因组科学数据中心基因组数据库GWH从GenBank收录的痘病毒科基因组和蛋白序列,用户可基于Accession号、种名、属名、采样日期、采样地址、宿主、分离源、颁布日期、序列长度和序列齐全性等元信息筛选感兴致的痘病毒科病毒株,个性化拔取元信息和序列进行下载,发展有关的科学钻研。

  MPoxVR提供了丰硕的猴痘病毒基因组变异分析统计和注解信息。该库以本次盛行第一条公开颁布的猴痘病毒序列(ON563414.3)为参考序列,发展猴痘病毒株基因组变异分析,并对了局进行了统计与可视化展示。通过对全基因组序列变异位点分析,获取猴痘病毒株的变异水平、变异区域、变异碱基的具体信息,获得全球领域内猴痘病毒基因组变异图谱。对猴痘病毒株的基因组变异分析可为追忆病毒起源、追踪病毒株变异蹊径、防控猴痘病毒引发的疫情及医治提供重要的数据基础与决策支持。

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猴痘病毒基因组序列全球散布动态

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猴痘病毒基因组序列颁布动态

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猴痘病毒基因组变异分析统计了局

 

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