北京基因组所（国度生物信息中心）开发单细胞全基因组甲基化数据库scMethBank
近日 ，亚星游戏（国度生物信息中心）国度基因组科学数据中心开发的单细胞全基因组甲基化数据库（scMethBank）正式上线 。该钻研成就以“scMethBank: a database for single-cell whole genome DNA methylation maps”为题在国际学术期刊Nucleic Acid Research 在线颁发 。
作为表观基因组学的重要组成部门 ，DNA甲基化为钻研基因组印迹、早期胚胎发育和癌症进展等生物学过程提供了重要视角 。随着单细胞测序技术的不休发展 ，在单细胞分辨度钻研DNA甲基化成为可能 ，也极大地推进了细胞表观遗传异质性的索求 。然而 ，由于不足美满的尺度化数据分析技术及流程及相应的单细胞甲基化数据资源平台 ，对于分歧尝试起源的海量的单细胞甲基化样本数据的整合和再利用面对着巨大的挑战 。针对这些问题 ，国度基因组科学数据中心钻研团队开发了scMethBank数据库 。
scMethBank 是一个盛开接见和综合性的全基因组单细胞DNA甲基化数据库 ，网络基于重亚硫酸氢盐转换的单细胞原始测序数据 ，以尺度化的工作流程在单碱基分辨率下检测甲基化状态并构建多种状态下的单细胞甲基化图谱 。数据库目前收录了来自于15个公开的单细胞数据集的8328个单细胞全基因组重亚硫酸氢盐测序数据和人为审编的元数据 ，涉及人和幼鼠两个物种、29种细胞类型和两种疾病状态 。
scMethBank提供敦睦的用户界面 ，以支持交互式的单细胞甲基化数据的查问、浏览和使用 。同时 ，数据库还提供一系列为单细胞甲基化数据设计的在线分析和可视化工具 ，蕴含差距甲基化区域（DMR）注解、富集分析、差距甲基化区域画图等 ，通过网络服务器援手用户分析、诠释和利用单细胞甲基化数据 。scMethBank是目前第一个较全面的单细胞甲基化数据库 ，并有望成为单细胞表观遗传钻研的重要数据资源和分析平台 。
北京基因组钻研所（国度生物信息中心）博士钻研生宗文婷及亢红恩为本文共同第一作者 ，李茹姣高级工程师与鲍一明钻研员为共同通讯作者 。该钻研得到了中科院战术性先导科技专项、国度重点研发打算、中科院关键人才打算等项目赞助 。
论文链接
scMethBank数据处置流程与重要内容
