国际核酸钻研杂志2018数据库专刊连登四篇北京基因组所性命与健全大数据钻研成就
2018年1月4日,国际核酸钻研(Nucleic Acids Research)数据库专刊,连登四篇北京基因组所性命与健全大数据钻研成就,蕴含性命组学数据资源建设成就(D14-20)、实时定量PCR内参基因知识库—ICG(Internal Control Genes;D121-126),甲基化数据库Methbank升级版(D288-295)以及基因组序列变异库—GVM(Genome Variation Map;D944-949)。四篇文章在核酸钻研杂志的颁发,标志取我国综合型生物信息资源库建设获得国际同前进一步认可。
自上世纪60年代以来,国际生物信息学家成立了一系列的数据库。出格是上世纪90年代,随着人类基因组打算的发展以及网络在全球遍及,数据库数量和体量迅猛增长,形成了以NCBI、EBI、DDBJ等为代表的多个国际大数据中心。随着测序技术不休发展,我国已成为国际基因组数据最大产出国之一,但我国产出的组学数据绝大部门必须提交到国表数据库能力得到认可。据Database Commons数据库统计,我国数据库资源总数已位居世界第二,但大部门数据库没有进行持久运行守护,严重不足深度人为审编,数据库内容边缘化,最终了局是大量数据库资源质量不高,利用率低。
中科院北京基因组钻研所面向国度大数据发展战术和科技创新战术,成立性命与健全大数据中心,成立生物大数据贮存、整合与挖掘分析钻研系统,构建的GSA(Genome Sequence Archive)数据库已发展原始组学数据存储与共享服务,并与国际接轨,存储的数据已支持Cell、Nature Communications、PNAS、Genome Research等杂志文章颁发,建成我国生物大数据汇交共享平台,成为继NCBI、EBI、DDBJ之后第四个综合基因组权威数据库。同时,还建成了生物大数据多档次组学层面的数据资源系统,蕴含基因组归档数据库Genome Warehouse、基因组变异数据库Genome Variation Map、基因表白数据库Gene Expression Nebulas、甲基化数据库Methylation Bank、生物知识库Science Wikis,对我国科学钻研和产业创新发展起到了重要支持作用。
该钻研得到国度重点研发打算、国度天然基金委、亚星游戏战术性先导科技专项、亚星游戏国际大科学打算等项目基金的赞助。






