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　　近日，基因组所所级中心基因组平台三代单分子实时测序PacBio实现技术升级优化，实现了数据产量和读长的双重提升，一个SMRT Cell芯片可产出高达1Gb数据， reads均匀长度达到14kb，N50超过19kb，为基因组学有关钻研提供了有力支持。

　　PacBio 测序read和subread长度散布 

　　利用三代单分子实时测序仪PacBio系统，平台提供的技术支持服务蕴含：

　　1.基因组de novo测序组装 

　　PacBio测序read超长的特点，适合于基因组de novo组装。例如一个5Mb大幼的细菌基因组，只需一个SMRT Cell测序即可实现基因组finish，周期幼于5天。对于复杂基因组,预期Contig N50超过100kb，推荐de novo组装需50ⅹ以上的PacBio测序覆盖，二代测序数据和PacBio测序数据混合组装，推荐30ⅹ以上的PacBio测序覆盖，如用于基因组scaffold构建，推荐10ⅹ以上的PacBio测序覆盖。 

　　2.全长转录本测序 

　　受传统测序技术短读长的限度，较难获得全长转录本序列。在PacBio测序平台上，我们开发了全长cDNA测序和分析技术流程。PacBio测序产生的read长度弘远于绝大部门cDNA长度，因而无需经过后续序列拼接组装，即可获得正确全长cDNA序列，分析基因转录后可变剪切信息以及LncRNA表白等。 

　　3.碱基建饰检测 

　　PacBio测序另一个优势是可获得DNA聚合酶促反映的分子动力学数据，分析碱基建饰信息。由于碱基基团建饰后的位阻作用，DNA聚合酶在带有建饰碱基的核苷酸地位前后，阐发出延滞效应，经推算分析得到IPD ratio差距,分歧建饰的IPD ratio值分歧，从而获取碱基建饰信息。目前测序比力正确的建饰类型是m6A,另表5mC、5hmC、4mC等建饰信息也可得到，但必要特殊的样品处置或数据处置。 

　　此表，基于PacBio系统，平台还提供基因组BAC克隆混合测序、长扩增子测序、极端GC含量DNA测序等技术开发服务。