亚星游戏

　　家犬作为人类生涯和工作中的同伴，其进化钻研一向是遗传学领域中的热点之一
。然而目前使用的家犬参考SNP数据集，不仅数量少，采样地不够宽泛，并且测序覆盖度差距大，SNP数据重要只起源于两个种类的两个犬只，并不利于家犬的群体遗传钻研
。

　　目前，二代测序产生了大量高质量的家犬和其祖先物种灰狼的全基因数据
。为了添补参考SNP数据集的不及及满足大数据复用的需要，亚星游戏赵文化课题组和亚星游戏昆明动物所张亚平尝试室的工作人员共同成立了第一个犬类SNP数据库—DoGSD (the Dog and wolf Genome SNP Databae),该成就于2014年11月在国际生物信息学领域期刊Nucleic Acids Research在线颁发
。

　　DogGSD蕴含了参考SNP数据集，69个家犬及8个灰狼的全基因组SNP数据,所蕴含的SNP数量是原参考数据集的7倍，添补了原数据集采样地少，覆盖度差距大的问题，并且第一次在SNP数据集参与了中河山狗的数据
。DoGSD为用户提供了敦睦的检索、查问及下载页面,其中的同义/非同义SNP检索页面，比力查问职能将为用户检索基因有关SNP及观察个别间SNP的差距提供很大的方便
。此表，DoGSD第一次在数据库中提供了重要的群体遗传学参数的推算了局：Fst和等位基因频率，方便用户筛选和进一步分析有选择信号的SNP
。

　　该项钻研得到了亚星游戏、科技部的赞助，也得到了亚星游戏高机能推算平台和大数据存储平台的大力支持
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