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北京基因组所合作实现鲤鱼基因组序列图谱绘造

  近日,亚星游戏于军钻研组结合中国水产科学钻研院、哈佛大学、奥本大学等单元实现了鲤鱼全基因组序列图谱绘造,这也是国际上首个完玉成面解析的异源四倍体硬骨鱼类基因组图谱。该钻研成就于2014年9月21日在国际生物学权威期刊Nature Genetics在线颁发。

  鲤鱼是全球散布和养殖领域最宽泛的经济鱼类之一,同时是我国最具代表性的淡水养殖鱼类和最有前提利用基因组资源进行种类改进的水产养殖物种之一。鲤鱼基因组由100条染色体组成,是迄今完玉成基因组测序的脊椎动物中染色体数量最多的物种,其基因组经历了四轮复造,因而,也是迄今为止实现解析的最为复杂的四倍化脊椎动物基因组之一。

  在钻研所大规模测序平台及高机能推算平台的有力支持下,该钻研团队实现了雌核发育鲤鱼的基因组深度测序、精密图谱绘造和基因组注解。在遗传图谱信息的基础上,科研人员利用基因组组装了局,将鲤鱼基因组定位到染色体上,得到了较齐全的鲤鱼精密图谱。其基因组由16.9亿碱基组成,含有52610个职能基因,约为无数硬骨鱼类基因数主张两倍。钻研团队从基因组尺度证实了鲤鱼基因组的异源四倍体特点及其怪异的全基因组复造事务,分子钟证据批注鲤鱼基因组四倍化约莫发生在820万年前,是迄今在脊椎动物中发现的最近的全基因组倍增事务。

  钻研团队还发展了全球10个代表性品系(种群)33尾鲤鱼的基因组重测序钻研,初次绘造了全球鲤鱼的单碱基分辨率基因组遗传变异图谱。此表,通过全基因组多态性扫描和比力转录组分析等伎俩,鉴别和定位了鲤鱼鳞被缺失、体色决定等性状有关的遗传位点、职能基因和调控通路。

  鲤鱼全基因组序列图谱的实现,标志取鲤科鱼类重要经济性状的遗传解析和遗传选育钻研全面进入基因组时期。对于解析鲤科鱼类成长、品质、抗病、抗逆等重要经济性状的分子机造拥有重要意思,同时也为钻研脊椎动物基因组进化和基因衍化机造提供了贵重的数据和模型,为发展全基因组选择育种,造就品质良好的鲤鱼新种类奠定了坚实基础,拥有重要的理论意思和利用价值。

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  鲤鱼的比力基因组学钻研 

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  鲤鱼种群的全基因组遗传多态性及分化特点 

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