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基因组所反复序列与哺乳动物基因组内含子扩张关系钻研获进展

近日,在亚星游戏副所长、基因组科学与信息重点尝试室主任于军钻研员,和雷红星钻研员的领导下,基因组所王大鹏博士、博士钻研生苏尧等科研人员,在哺乳动物基因组内含子扩张与基因职能关系钻研,及突变和天然选择在基因组进化中的作用钻研获得新进展,有关学术论文在《Evolutionary Bioinformatics》杂志颁发。

基因组反复序列(Repetitive Sequence,RS)是复杂且进化活跃的,其对基因和基因组结构的不变和动态性有着很大影响,并且与生物学职能亲昵有关。处于分歧基因结构区域如表显子、内含子和基因间区的反复序列受到分歧水平选择压力的影响。通常来说,这些序列反复的DNA片段通常被分为两类:即卫星序列(Satellite Sequences,SSs)和转座元件(transposable elements,TEs)。目前,很多脊椎动物的基因组测序工作已经实现,这为钻研分歧脊椎动物物种中TE和SS疏导的内含子扩张提供了前提。

为了钻研内含子序列中TE和SS的进化特点,科研人员拔取12种哺乳动物基因组按进化分支分成4组:灵长类、大型哺乳类、啮齿类和原始哺乳类,并用4种非哺乳类脊椎动物作为表群。钻研批注:受TE或SS摆布的内含子扩张机造在内含子长度、地位和基因职能等方面拥有特定的分支特异性。钻研发现,TE增长内含子长度的趋向比SS要强,TE和SS对哺乳动物的综合影响要大于任何两者之一的单独影响之单一加和,而在非哺乳脊椎动物中的情况则相反。

在天然选择的作用下,TE和SS衍生的反复序列阐发出的作用在分歧水平和作用机造上影响了脊椎动物基因和基因组的大幼及组分,也是造成物种分化(脊椎动物各类档次的类别)和物种多样性的重要成分。该钻研成就将援手科研人员加深对于基因组非编码区域的职能调控和进化法规的理解和意识。

 

文章链接:

http://www.la-press.com/transposon-derived-and-satellite-derived-repetitive-sequences-play-dis-article-a3227

 

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4种内含子的地位对比

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