亚星游戏

基因组所实现鲤鱼基因组初步测定分析

2010年3月,亚星游戏使用新一代高通量测序技术以及高机能的生物信息分析,实现了鲤鱼基因组初步测定与分析工作,获得了鲤鱼基因组高覆盖的基因组数据。“鲤鱼基因组打算”是基因组所与水产生物利用基因组钻研中心和黑龙江水产钻研所结合发展的钻研项目,目前项目进展顺利,是我国鱼类第一个全基因组测序打算,也是世界上第一个鲤科经济鱼类基因组打算。

本项目重要依附于基因组所基因组及生物信息学平台第二代高通量测序仪进行测序分析工作,该平台占有13台新一代高通量测序仪(SOLiD、Solexa和 454测序仪)、3台3730xl,1台3130xl的测序规模,占有超过10万亿次/秒的推算能力和大于1000TB的存储。目前已经实现部门454shotgun文库段测序,总体数据已经达到4乘的覆盖度,实现部门组织转录组的工作,为基因组注解提供参考。目前该项目在加紧进行生物信息学的分析,预计将比打算提前实现鲤鱼基因组框架图的工作。

科学家但愿通过鲤鱼基因组测序及其序列分析为钻研养殖鱼类的成长、发育、滋生、遗传变异、疾病、与环境的相互用(蕴含抗逆能力)及其遗传改进提供重要的参考甚至领导信息。通过鲤鱼基因组的钻研,能够获得与经济性状有关的基因,与疾病的发生及免疫有关的基因等,为鲤鱼的遗传育种提供基础。

随着人和其它重要动植物基因组的破译,模式动物和经济动物基因组打算方兴未艾,越来越多的鱼类被提上议程,世界列国的科学家相继实现了一些鱼类的基因组测序和分析工作,多数以本区域或者本国的鱼类产品为主,例如日本实现的青鳉鱼,挪威和加拿大共同实现的大西洋鲑等。作为我国鱼类平散布最广、种类最多、产量最高的鲤鱼基因组打算的发展,是我国水产科研步入现代科学先进行列的标志性事务,将对我国甚至世界水产业的发展产生重要的影响。

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