《基因组蛋白质组与生物信息学报》2009年第3期内容推介
2009年第3期《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics)重点关注了几种致病微生物的有关钻研。其中,我所胡松年钻研组的张国强等使用新步骤对结核杆菌(Mycobacterium tuberculosis)蛋白进行筛选和检测以分辨结核病人和卡介苗接种者,获得了优良成效。四川大学鲍锦库钻研组凭据水平基因转移的理论使用生物信息学步骤对稻瘟菌(Magnaporthe grisea)的习染机造进行了分析,并发现了某些可能的水平转移基因。伊朗Shiraz大学的Hassan Mohabatkar等对利什曼原虫(Leishmania major)的10种半胱氨酸蛋白酶序列做了生物信息学分析,为疫苗研发提供了有益援手。印度的K. Natarajaseenivasan蹬酌系统发生步骤分析了钩端螺旋体(Leptospira)表膜脂蛋白编码基因ompL1, lipL32和lipL41的抗原变异性,发现了某些特定差距,对有关疫苗的研发将起到重要作用。
此表,本期还颁发了我所基因组科学与信息重点尝试室的王大鹏等对代替率变量影响非同义代替率(Ka)和同义代替率(Ks)推算的钻研成就,希腊的Pantelis G. Bagos等对膜蛋白结构预测的钻研,以及两款生物信息学的利用软件。
本期的网上全文能够在Elsevier出版集团的ScienceDirect数据库(www.sciencedirect.com/science/journal/16720229)中浏览下载,同时迎接各人积极引用、投稿。
附:本期目录
In silico analysis of the potential infection mechanisms of Magnaporthe grisea from horizontal gene transfer hypothesis P77-86
Computational analysis of cysteine proteases (clan CA, family C1) of Leishmania major to find potential epitopic regions P87-95
Evolutionary implication of outer membrane lipoprotein-encoding genes ompL1, lipL32 and lipL41 of pathogenic Leptospira species P96-106
Screening and assessing 11 Mycobacterium tuberculosis proteins as potential serodiagnostical markers for discriminating TB patients from BCG vaccinees
P107-115
How do variable substitution rates influence Ka and Ks calculations? P116-127
How many 3D structures do we need to train a predictor? P128-137
PBOND: web server for the prediction of proline and non-proline cis/trans isomerization P138-142
3D Genome Tuner: compare multiple circular genomes in a 3D context P143-146






